Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP20Q9Y2K6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms