Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POMPQ9Y244 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms