Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms