Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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