Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms