Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MARCH4Q9P2E8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.8 ms