Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNTN3Q9P232 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms