Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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