Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms