Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TMEM27Q9HBJ8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TMEM27Q9HBJ8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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