Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEBOXQ9HB31 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SEBOXQ9HB31 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SEBOXQ9HB31 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEBOXQ9HB31 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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