Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP1Q9C000 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms