Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms