Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms