Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms