Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC46A2Q9BY10 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms