Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SNHG12Q9BXW3 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms