Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms