Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms