Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MESP1Q9BRJ9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MESP1Q9BRJ9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms