Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BPIFA3Q9BQP9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BPIFA3Q9BQP9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms