Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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SEMA3CQ99985 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SEMA3CQ99985 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SEMA3CQ99985 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SEMA3CQ99985 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SEMA3CQ99985 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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SEMA3CQ99985 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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