Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMAD5Q99717 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms