Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYCBPQ99417 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms