Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3AQ96ST3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms