Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf85Q96MD7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms