Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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USP47Q96K76 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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USP47Q96K76 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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USP47Q96K76 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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USP47Q96K76 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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USP47Q96K76 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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