Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms