Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COG3Q96JB2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms