Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA4DQ92854 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA4DQ92854 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms