Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms