Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms