Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN19Q8N6F1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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CLDN19Q8N6F1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN19Q8N6F1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN19Q8N6F1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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