Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PARP8Q8N3A8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARP8Q8N3A8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms