Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TRAPPC6BQ86SZ2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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TRAPPC6BQ86SZ2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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