Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms