Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CCDC80Q76M96 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CCDC80Q76M96 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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CCDC80Q76M96 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CCDC80Q76M96 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CCDC80Q76M96 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC80Q76M96 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CCDC80Q76M96 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC80Q76M96 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC80Q76M96 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC80Q76M96 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC80Q76M96 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC80Q76M96 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC80Q76M96 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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