Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms