Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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