Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms