Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms