Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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COL5A1-AS1Q5SY13 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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