Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms