Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL139220.2-207ENST00000434244 2644 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SLC7A3-202ENST00000374299 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39Q53RE8 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms