Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms