Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms