Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms