Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms