Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf22Q49AR2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms