Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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